PFA和PTFE这两种含氟聚合物有一些显著的机能上的差距，要选择相宜的工艺上的聚合物，烷氧基取代基上的差距能够使PFA通过传统的注射造模和螺杆挤出的工艺来进行熔断加工，而PTFE则不能和PFA一样加工，PFA材质的加工矫捷性更高，但是PFA的弹性寿命比PTFE更低，由于造作的产品不能接受住反复的折叠。PTFE拥有较高的耐热性，但是流动性、蠕变性、热不变性相对来说要不足一些。

PFA和PTFE的熔点别离为260摄氏度和327摄氏度，吸水率微风华作用的影响对PFA要大于PTFE，但是PFA的耐盐雾机能要高于PTFE。

两种含氟聚合物最显著的特点是介电强度，PFA的介电强度则是PTFE的3到4倍。